Layanan Rawat Inap di RS Pratama terdiri dari Instalasi Rawat Dewasa (IRD), Instalasi Rawat Anak (IRA), Instalasi Maternal dan Perinatal (IMP) dan High Care Unit (HCU). Instalasi Rawat Dewasa memiliki Bangsal Dewasa dengan jumlah bed 8 dan 2 kamar isolasi.

Bangsal Anak di RS Pratama didesain dengan nuansa yang menyenangkan sehingga diharapkan memberikan kenyamanan pada pasien anak yang dirawat. Bangsal Anak memiliki 8 bed dan 2 kamar isolasi. Bangsal Maternal dan Perinatal masing-masing memiliki 10 bed lengkap dengan Perinatologi Box sebagai ruang rawat bayi.

Sementara High Care Unit (HCU) sebagai salah satu layanan unggulan RS Pratama memiliki 6 bed perawatan.

Sebagai rumah sakit Tipe D tanpa kelas, semua layanan Rawat Inap RS Pratama setara dengan Kelas 3, namun RS Pratama berusaha memberikan kenyamanan bagi pasien dengan ruangan yang bersih dan menggunakan AC.