Poli penyakit dalam merupakan layanan poli di RS Pratama Yogyakarta yang menangani berbagai keluhan, gejala, dan masalah terkait organ dalam. Saat ini RS Pratama memiliki dua dokter spesialis penyakit dalam yang profesional dan berpengalaman di bidangnya, yakni dr. Wawan Tri Harjanto, Sp.PD dan dr. Prafita Cahya Dewanti, Sp.PD.

Poli Penyakit Dalam RS Pratama melayani pasien setiap Senin s.d. Sabtu, mulai pukul 07.00 s.d. 11.00 WIB. Untuk mengakses layanan Poli Penyakit Dalam, pasien harus melakukan reservasi terlebih dahulu. Ada 2 (dua) cara untuk melakukan reservasi layanan Poli Penyakit Dalam:

1. Reservasi Online melalui aplikasi Jogja Smart Service (dapat diunduh dari Google Play Store) pada menu Antrian RS Pratama.

2. Reservasi Offline, yakni dengan datang langsung ke Bagian Pendaftaran RS Pratama mulai pukul 10.00 WIB s.d. 12.00 WIB pada hari kerja untuk melakukan reservasi layanan Poli Penyakit Dalam pada hari berikutnya hingga H+7.

Setelah mendapatkan kode reservasi, pada hari pelayanan pasien harus melakukan check-in pada waktu yang sudah ditentukan pada tiket reservasi untuk mencetak nomor antrian.